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Validação de marcadores microssatélites e diversidade genética de genótipos de Coffea arabica provenientes da Etiópia
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Silva, Bruna Silvestre Rodrigues Da Cação, Sandra Bellodi Ferreira, Rafaelle Vecchia Santos, María Aparecida Ivamoto, Suzana Tiemi Silva, Juliana Costa Androcioli, Leonardo Godoy Domingues, Douglas Silva Leroy, Thierry Charmetant, Pierre Sera, Gustavo Hiroshi Pereira, Luiz Filipe Protasio |
| Copyright Year | 2015 |
| Abstract | O cafe e uma valiosa commodity agricola, sendo sua bebida uma das mais populares do mundo. Apesar do sucesso dos programas de melhoramento em Coffea arabica, o desenvolvimento de novas cultivares e demorado, podendo levar mais de 20 anos. Alem disso, a estreita base genetica de C. arabica pode dificultar a obtencao de cultivares resistentes a pragas e a doencas ou tolerantes a estresses abioticos. Os acessos selvagens de C. arabica geneticamente distantes das variedades cultivadas proporcionam novos alelos para enriquecer sua variabilidade genetica. O objetivo deste trabalho foi validar marcadores moleculares do tipo SSR em um painel de 24 acessos de C. arabica da colecao da Etiopia, realizar um estudo da diversidade, estrutura e selecao de genotipos para futuros trabalhos de introgressao no melhoramento. Neste trabalho foram utilizados 58 marcadores microssatelites (SSR) obtidos de analises in silico a partir de dados de RNA-seq da cultivar Iapar 59 e de sequencias de BACs de Hibrido de Timor 832/2, e 77 SSR obtidos de uma extensa revisao bibliografica em C. arabica e/ou C. canephora. Dos 135 SSR utilizados, 122 resultaram em produtos de amplificacao e 31 foram polimorficos no painel. Desses, 20 SSR foram altamente informativos com valores de PIC acima de 0,7, e sete sao descritos pela primeira vez. Um total de 165 alelos foram obtidos com media de 5,3 alelos por loco. O estudo de diversidade e estrutura genetica dos acessos separou os genotipos em tres principais grupos. A utilizacao de marcadores SSR informativos assim como o estudo de diversidade e estrutura genetica destes e dos demais acessos permitira a criacao de uma colecao nuclear, facilitando a conservacao, acessibilidade e uso de recursos geneticos de cafeeiros da Etiopia. (Resume d'auteur) |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | http://www.sbicafe.ufv.br/bitstream/handle/123456789/3664/45_IX-SPCB-2015.pdf;jsessionid=8EB01830E52C2C1B34CF1676CF2DAB43?sequence=1 |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
