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Etudes structurales du complexe de réplication des Rhabdoviridae et des Paramyxoviridae. Les interactions entre la phosphoprotéine et la nucléoprotéine
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Yabukarski, Filip |
| Copyright Year | 2013 |
| Abstract | Le virus de la stomatite vesiculaire (VSV) et le virus Nipah (NiV) appartiennent respectivement aux familles des Rhabdoviridae et des Paramyxoviridae. VSV est un modele du virus de la rage tandis que NiV est un virus emergeant, appartenant a la sous-famille des Paramyxovirinae, pour lequel les donnees moleculaires et structurales sont limitees. Ces sont des virus enveloppes dont le genome code pour cinq a neuf proteines. Le complexe de replication de ces virus est constitue de trois proteines : la phosphoproteine (P), la nucleoproteine (N) et la polymerase virale (L). La N encapside le genome viral et l'ensemble N-ARN sert de matrice pour la transcription et la replication. La P joue deux roles : elle sert de cofacteur pour la polymerase et forme le complexe N0-P qui maintient la N sous une forme soluble, competente pour l'encapsidation des genomes neo-synthetises. Un premier objectif de mon travail de these consistait a etudier la structure et la dynamique des proteines P de VSV et de NiV. Ce sont des proteines modulaires qui contiennent des domaines structures, separes par des regions flexibles. A mon arrivee au laboratoire un travail important avait ete deja realise sur la P de VSV et j'ai participe a l'achevement de cette etude. Je me suis ensuite interesse a la proteine P de NiV. J'ai cristallise et resolu par diffraction des rayons X les structures du domaine C-terminal et du domaine central (codes PDB : 4F9X et 4GJW). La combinaison de ces modeles cristallographiques avec des donnees de SAXS sur la P entiere et des donnees de resonance magnetique nucleaire (RMN, collaboration IBS) va permettre d'obtenir un modele atomique de la P entiere sous la forme d'un ensemble de conformeres. Un deuxieme objectif etait d'etudier les complexes N0-P. J'ai activement participe au developpement de la methode de reconstitution et a la caracterisation structurale du complexe N0-P de VSV, entre un mutant de la N (NΔ21) et un peptide N-terminal de la P (code PDB : 3PMK). J'ai ensuite reconstitue, cristallise et resolu la structure de complexe N0-P de NiV entre la N (tronquee de son domaine C-terminal) et la partie N-terminale de la P. Ces structures montrent par quel mecanismes moleculaires la P maintien la N sous forme monomerique, en empechant sa polymerisation et son interaction avec l'ARN. Les resultats presentes ici ont permis de generer de nouvelles hypotheses pour expliquer les mecanismes d'encapsidation et d'initiation de la synthese d'ARN chez ces virus. Le complexe N0-P etant essentiel pour la replication du virus, l'information structurale obtenue au cours de ce travail devrait permettre d'envisager l'utilisation de ce complexe comme cible pour le developpement de composes antiviraux. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01424101/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |