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Étude des mécanismes de régulation à distance du gène CFTR
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Moisan, Stéphanie |
| Copyright Year | 2014 |
| Abstract | Le gene CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator) a ete identifie en 1989. Vingt-cinq ans apres, les mecanismes controlant sa fine expression, sont encore mal compris. Bien qu’environ 1980 mutations aient ete decouvertes, il reste des patients pour qui le genotype n’a pas ete etabli. Les elements de regulation, decrits au sein du promoteur, ne peuvent a eux seuls expliquer cette complexe regulation tissu specifique. Des elements de regulation a distance, en cis ou en trans, sont certainement impliques dans ce controle d’expression. L’objectif de ce projet est de mieux decrypter les mecanismes de regulation a distance du gene CFTR en identifiant des sequences regulatrices eloignees, mais pouvant, par des mecanismes de repliement, interagir specifiquement avec celui-ci. Afin d’etudier ces contacts chromosomiques, nous avons, dans un premier temps, mis au point la technique de Capture de Conformation Chromosomique (3C). Suite a cette technique, nous sommes passes a une approche a plus grande echelle, la technique de Copie Conforme de 3C (5C), qui permet de mesurer des milliers d’interactions chromatiniennes en une analyse. L’organisation spatiale d’une region d’environ 790 kb recouvrant le gene CFTR, a ete analysee dans des cultures primaires de cellules epitheliales nasales, exprimant le gene CFTR et des fibroblastes de peau, ne l’exprimant pas ou tres peu. Les interactions entre les regions de ce locus et le promoteur CFTR ont ete etudiees par sequencage nouvelle generation sur Ion PGM™. Nous avons compare ces conformations chromatiniennes afin d’identifier des elements de regulation specifiques d’une expression de CFTR. Notre approche a ete validee par l’identification de regions regulatrices precedemment decrites. De plus, nous avons mis en evidence de nouveaux contacts chromatiniens avec le promoteur CFTR. Ces regions semblent fortement impliquees dans la regulation de l’expression du gene CFTR. Grâce a la technique 3C et ses variantes, l’identification de nouvelles mutations a distance du gene pourraient expliquer des deregulations de son expression. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01364781/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
