NDLI: Outils d'analyse d'images et recalage d'individus pour l'étude de la morphogenèse animale et végétale

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Outils d'analyse d'images et recalage d'individus pour l'étude de la morphogenèse animale et végétale

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Michelin, Gaël
Copyright Year	2016
Abstract	En biologie developpementale, l'etude d'organismes modeles vise a comprendreles mecanismes genetiques responsables de la morphogenese chez le vivant. Lamicroscopie confocale a fluorescence permet aujourd'hui d'observer in vivo al'echelle de la cellule et avec une haute frequence temporelle le developpementd'organismes. Les sequences d'images 3D+t ainsi obtenues necessitent d'avoirdes outils de traitement d'images adaptes.Dans cette these, nous construisons des outils dedies a l'etude dudeveloppement de deux organismes, l'embryon de l'ascidie Phallusiamammillata et le bouton floral d'Arabidopsis thaliana.Nous developpons d'abord une methode de comparaison de segmentationsadaptee aux images de tissus epitheliaux d'organismes en developpement.Nous nous appuyons sur cet outil pour valider notre seconde contribution quiporte sur la mise en place d'un outil de detection et de reconstruction demembranes cellulaires concu afin de proceder a la segmentation de cellulesdans les images d'ascidies et d'arabidopsis.Nous utilisons ensuite l'outil de segmentation de membranes precedemmentintroduit pour construire une strategie de recalage spatial inter-individusappliquee aux embryons d'ascidies. Enfin, nous elaborons une strategie derecalage spatio-temporel inter-individus appliquee a des sequences d'images 3Dde meristemes floraux
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01451608/file/2016AZUR4088.pdf
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01451608/document
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article

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