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Identification et caractérisation fonctionnelle de régions du génome associées à des caractères d'intérêt pour la filière caprine
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Martin, Pauline |
| Copyright Year | 2016 |
| Abstract | Un important dispositif de detection de QTL caprin laitier base sur 2 254 chevres genotypees sur puce SNP 50K et issues de 20 mâles d'IA sequences a ete mis en place. Des QTL avaient deja ete detectes pour de nombreux caracteres laitiers ou de morphologie. Un certain nombre de caracteres restait neanmoins a etudier ou a approfondir. Dans un premier temps, une analyse de type GWAS a ete realisee sur cinq caracteres. Pour deux d'entre eux, les trayons surnumeraires et le debit de traite, nos resultats sont en faveur d'un determinisme polygenique. Pour deux phenotypes de coloration indesirables en race Saanen et la presence de pampilles, une region du genome a ete trouvee comme tres significativement associee au phenotype (chromosomes 11, 13 et 10 respectivement). Le gene ASIP est un candidat fonctionnel et positionnel tres prometteur pour le QTL du chromosome 13 qui agit sur la coloration rose des animaux Saanen. En revanche, malgre une analyse plus poussee des deux autres zones via l'analyse de sequences et des genotypages, aucune mutation causale candidate n'a pu etre identifiee. Enfin, nous avons etudie deux mutations associees a des differences de taux butyreux qui avaient ete precedemment identifiees dans le gene DGAT1 caprin. Apres avoir produit in vitro les differentes versions de la proteine en systeme " baculovirus/cellules de lepidoptere ", l'activite enzymatique des differents variants a ete testee sur le diglyceride DAG 10 :10. Nos resultats confirment l'effet deletere des mutations sur la production de triglycerides et signent ainsi la causalite de ces mutations. Ces travaux ont permis de mettre en evidence de nouvelles regions du genome impliquees dans le controle de caracteres d'interet pour la filiere et ont prouve la causalite de deux mutations. L'ensemble de ces resultats pourra aider la filiere a mieux gerer ces phenotypes dans le schema. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01489251/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
