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Caractérisation des gènes AP2/ERF impliqués dans le développement chez Hevea brasiliensis
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Piyatrakul, Piyanuch |
| Copyright Year | 2013 |
| Abstract | Hevea brasiliensis est une culture industrielle majeure pour la production de caoutchouc naturel (CN). La stimulation par l'ethephon, un liberateur d'ethylene, est utilisee pour augmenter la production de latex en prolongeant son ecoulement et en stimulant le metabolisme pour la regeneration du latex. Cependant, le mecanisme d'action de l'ethylene n'est pas clairement elucide chez l'hevea. L'ethylene est un signal important qui regule le developpement des plantes. Les facteurs de transcription AP2/ERF, et plus particulierement les Ethylene Response Factors, jouent un role crucial dans le developpement et la reponse aux stress biotiques et abiotiques chez les plantes. La production d'ethylene et sa signalisation sont aussi importantes en embryogenese somatique et tout specialement chez les especes recalcitrantes a la culture in vitro. Dans cette etude, le transcriptome de reference a ete ameliore par addition des fragments de sequence d'ARN issus de tissus reproducteurs lors d'un nouvel assemblage. Les 30.342 contigs ont ete annotes par la base de donnees Gene Ontology. L'analyse des facteurs de transcription a permis d'identifier 2.448 contigs qui ont ete classes en 58 familles de facteurs de transcription. Six pourcents de ces facteurs de transcription correspondent aux membres de la superfamille des AP2/ERF. L'accumulation de transcrits des genes AP2/ERF a ete analysee au cours du processus d'embryogenese somatique chez des lignees de cal avec differents potentiels de regeneration et dans differents tissus vegetatifs et reproducteurs. L'analyse de l'abondance relative de transcrits dans les differents tissus montre que les ERFs des groupes I, VII et VIII sont fortement presents a tous les stades de l'embryogenese somatique et dans les tissus immatures et matures de fleurs males et femelle, d'embryons zygotiques, de feuilles, d'ecorce et de latex. Quarante genes AP2/ERF representent des marqueurs d'expression genique pour le potentiel de regeneration de plantes de lignees de cal a differents stades du processus d'embryogenese somatique. Quatorze marqueurs d'expression genique permettent meme de predire la capacite de regeneration des le stade de multiplication du cal. Cinquante-neuf marqueurs d'expression geniques sont specifiquement exprimes dans les differents tissus de l'hevea, et plusieurs AP2/ERFs ont les transcrits fortement accumules dans le latex. La plupart des marqueurs de l'expression genique du latex appartient aux ERF du groupe VII. Les ERFs de ce groupe ont un motif conserve en N-terminal (MCGGAII), lequel est implique dans la voie N-end rule. Les analyses de localisation subcellulaire et de transactivation suggerent que ces genes HbERF-VII codent pour des facteurs de transcription fonctionnels potentiellement impliques dans la reponse a l'hypoxie dans le latex. (Resume d'auteur) |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | http://agritrop.cirad.fr/572028/1/document_572028.pdf |
| Alternate Webpage(s) | http://www.supagro.fr/theses/extranet/13-0033_Piyatrakul.pdf |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
