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Etude du microbiote susceptible de persister sur les surfaces d'un atelier de la filière viande bovine
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Khamisse, Elissa |
| Copyright Year | 2012 |
| Abstract | Ce travail de these concerne l'etude de l'ecologie microbienne d'un atelier de decoupe de viande bovine, dans le but de mieux comprendre la persistance bacterienne, c'est-a-dire, la presence repetee d'un meme clone bacterien pendant une longue periode malgre l'application bien conduite et reguliere du nettoyage et de la desinfection (N-D). Des prelevements par « chiffonnages » multiples de surfaces d'equipements ont ete realises lors de trois campagnes de prelevement espacees les unes des autres d'au moins six mois. Les prelevements ont ete realises sur un tapis convoyeur en polychlorure de vinyle (PVC) et sur des machines eplucheuses en acier inoxydable avant et apres N-D. Nous avons quantifie les cellules totales (les cellules vivantes et les cellules mortes) par PCR quantitative en temps reel (qPCR), les cellules viables par EMA-qPCR, et les UFC (provenant de cellules cultivables) par denombrement apres incubation a 25°C sur gelose tryptone soja. Les resultats montrent qu'avant N-D, les cellules totales (en moyenne 5,6 – exprime en log10 cellules/cm2 – sur PVC et 4,7 sur acier inoxydable) sont plus nombreuses que les cellules viables (4,5 sur PVC et 4,4 sur acier inoxydable) lesquelles sont plus nombreuses que les UFC (3,8 sur PVC et 2,9 sur acier inoxydable). Le N-D entraine moins d'une reduction decimale (RD) des populations a l'exception des UFC sur acier inoxydable qui subissent 1,5 RD en moyenne. Ce dernier chiffre s'explique par des forces d'adhesion faibles. L'etude de la diversite des bacteries cultivables montre que sur un total de 51 genres identifies, 13 seulement sont retrouves lors des trois campagnes de prelevements. Les isolats de ces 13 genres representent 75, 72 et 62% des isolats des campagnes1, 2 et 3 respectivement. Parmi ces isolats, les plus frequents sont (par ordre decroissant du nombre d'isolats) : Pseudomonas, Staphylococcus, Microbacterium, Acinetobacter, Chryseobacterium, Psychrobacter et Kocuria. Le genotypage d'isolats de 3 genres majoritaires (Staphylococcus, Pseudomonas et Acinetobacter) montre qu'une seule souche, Staphylococcus equorum, est sans aucun doute persistante. L'ensemble de ces observations montrent que l'ecosysteme varie d'une campagne a une autre. Ces modifications de la diversite bacterienne refleteraient les modifications de flores des viandes traitees dans l'atelier, qui ont des origines multiples. En outre, il apparait que, contrairement a ce qui est generalement admis, les bacteries a coloration de Gram negative cultivables sont plus facilement inactivees par le N-D que les bacteries a coloration de Gram positive. L'etude de l'ecosysteme par PCR-DGGE a permis d'identifier sept genres bacteriens et montre que les especes dominantes sont toutes sous forme vivante, autrement dit, aucune des especes dominantes n'a ete detectee uniquement sous forme de cellules mortes. Sur les sept genres identifies six sont des Gram – dont majoritairement les genres Acinetobacter, Pseudomonas et Psychrobacter. Cette dominance montre que le N-D permet une forte perte de cultivabilite des bacteries Gram – mais qu'une grande partie n'est pas detachee. La dominance des bacteries Gram – observee par PCR-DGGE masque les staphylocoques qui ne sont pas detectes alors qu'ils sont majoritaires parmi la flore cultivable. Seul un genre bacterien, Propionibacterium, est identifie par PCR-DGGE uniquement mais il n'est trouve qu'a une seule campagne et uniquement sur l'acier inoxydable avant N-D. En conclusion, l'avancee majeure de ce travail est la mise en evidence qu'une proportion importante de bacteries survit apres les operations tres poussees de N-D mais pour une periode transitoire. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00770326/document |
| Alternate Webpage(s) | https://pastel.archives-ouvertes.fr/file/index/docid/770326/filename/These_E_KHAMISSE_Def.pdf |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
