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Communautés fongiques de sédiments marins de subsurface : diversité, origine et rôle écologique
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Rédou, Vanessa |
| Copyright Year | 2014 |
| Abstract | Au cours des vingt dernieres annees, les etudes sur les sediments marins profonds ont revele la presence et l'activite de communautes microbiennes inattendues. Il est maintenant formellement etabli que la biosphere profonde heberge de nombreux representants des domaines des Archaea et des Bacteria. Cependant,les micro-eucaryotes et plus particulierement les champignons n’ont ete que tres peu etudies dans ces ecosystemes singuliers. Dans ce contexte, des approches moleculaire et culturale ont ete utilisees afin de caracteriser la diversite des communautes fongiques des sediments marins profonds en utilisant le bassin de Canterbury comme modele d’etude. Les resultats principaux obtenus lors de ce travail de these sont les suivants : (i) L’approche moleculaire basee sur l’ADN a fourni la preuve directe que les communautes fongiques peuvent persister jusqu’a la profondeur record de 1740 metres sous la surface du plancher oceanique. (ii) Des approches complementaires ciblant les ARNr et les ARNm ont permis de preciser leur activite metabolique et d’obtenir de premiers indices sur les fonctions de ces champignons a 350m sous la surface du plancher oceanique, principalement liees a la croissance, a l’adaptation aux contraintes environnementales in situ et aux interactions entre communautes microbiennes. (iii) L’approche culturale a permis de constituer une collection de culture de 183 isolats fongiques avec des caracteristiques ecophysiologiques temoignant leur capacite d’adaptation aux conditions in situ. (iv) Le potentiel biotechnologique des isolats obtenus a ete estime via la recherche de genes impliques dans la synthese de metabolites secondaires et a permis de positionner cette collection d’organismes originaux comme une ressource d’interet biotechnologique potentiel. Ce travail qui temoigne de la persistance et de l’activite des communautes fongiques dans les sediments marins profonds elargit notre vision de la diversite microbienne dans ces milieux et souleve des hypotheses sur le role ecologique des champignons au sein de la biosphere profonde. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02153470/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |