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Exploration des mécanismes impliqués dans la bioprotection d'Agaricus bisporus par les biofilms de Bacillus subtilis QST713
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Pandin, Caroline |
| Copyright Year | 2018 |
| Abstract | Les pertes alimentaires mondiales se chiffrent a environ un tiers des aliments destines a la consommation humaine, soit environ 1,3 milliards de tonnes par an (FAO). Une large fraction de ces pertes est due aux alterations microbiologiques des denrees alimentaires. L’utilisation de produits phytosanitaires reste aujourd’hui la solution la plus largement utilisee en agriculture pour limiter ces pertes. Cependant, avec le plan EcoPhyto 2, le gouvernement francais a pour objectif de reduire de 50% l’usage des pesticides chimiques d’ici 2025, en particulier en promouvant l’emergence du biocontrole. Pour developper cette approche, il est cependant necessaire de comprendre, pour mieux les maitriser, les mecanismes sous-jacents. Les differents modes d’action de biocontrole par les microorganismes decrits sont la stimulation des defenses naturelles des plantes, la production de substances antimicrobienne et la competition nutritionnelle. L'originalite de ce projet est d'integrer le mode de vie en biofilm dans les mecanismes de bioprotection (competition spatiale et nutritionnelle, liberation de principes antimicrobiens). Dans la filiere Francaise des champignons de couche (Agaricus bisporus), l’agent de biocontrole utilise depuis 2008 par plus de 80 % de la filiere, est Bacillus subtilis QST713. Ce biofongicide montre une nette efficacite contre Trichoderma aggressivum, la principale moisissure a l’origine de pertes economiques lors de la culture d’A. bisporus. Afin d’accompagner la filiere dans cette voie biologique, nous avons entrepris de sequencer et etudier le genome de cette souche, afin de determiner son potentiel de biocontrole et sa capacite a former des biofilms. Nous avons egalement evalue l’impact de ce biofongicide sur la dynamique des communautes microbiennes du compost de culture d’A. bisporus expose ou non a T. aggressivum. Enfin, l'etude de la reprogrammation cellulaire de cet agent de biocontrole lors de sa culture en micromodeles axeniques, nous a permis une meilleure comprehension des phenomenes de colonisation des substrats et d'inhibition des flores indesirables. Ce projet a permis d’enrichir les connaissances vis-a-vis des mecanismes de biocontrole dans la filiere des champignons et pourra permettre une possible application a d’autres filieres agricoles. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02185011/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
