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Evolution des génomes du blé (genres aegilops et Triticum) au sein des Poaceae : dynamique rapide de l'espace occupé par les éléments transposables et conservation relative des gènes
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Charles, Mathieu |
| Copyright Year | 2010 |
| Abstract | Ma these vise a caracteriser l’evolution dynamique et l’organisation des genomes des differentes especes du ble (genres Triticum et Aegilops) en relation avec la proliferation des elements transposables (TEs) dans leur genome (>80%), les polyploidisations recurrentes ainsi que la syntenie avec d’autres especes de la famille des Poaceae. En constituant des sets de sequences genomiques representatives et en etudiant la variabilite entre des haplotypes des genomes du ble, j’ai caracterise la dynamique et la proliferation differentielle des TEs qui est la resultante de l’equilibre entre leurs insertions et aussi leurs eliminations actives. Le taux moyen de remplacement de l’espace TEs, mesurant les differences de sequences dues aux insertions et aux deletions entre deux haplotypes, a ete ainsi estime a 86% par million d’annees (Ma) et depasse celles bien documentees du mais. Les insertions des TEs mais aussi leurs eliminations par recombinaisons illegitimes de l’ADN (pouvant atteindre plusieurs dizaines de kb) ainsi que les recombinaisons genetiques entre haplotypes divergents representent les principaux mecanismes a la base des changements rapides de l’espace TEs. Sur une echelle d’evolution plus longue (60 Ma), j’ai analyse la conservation des genes et l’evolution du locus (Ha) entre differentes especes des Poaceae. J’ai pu ainsi preciser l’emergence du caractere grain tendre et des genes Ha, comme nouveaux membres de la famille des genes de Prolamine, dans l’ancetre commun des Pooideae (ble et Brachypodium, de la tribu des Triticeae et des Brachypodieae) et des Ehrhartoideae (riz), apres leur divergence des Panicoideae (mais, sorgho). |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://www.biblio.univ-evry.fr/theses/2009/2009EVRY0023.pdf |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |