NDLI: Filtragem robusta de SNPs utilizando redes neurais em DNA genômico completo

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Filtragem robusta de SNPs utilizando redes neurais em DNA genômico completo

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Silva, Bruno Zonovelli
Copyright Year	2013
Abstract	Com o crescente avanco das plataformas de sequenciamento genomico, surge a necessidade de modelos computacionais capazes de analisar, de forma eficaz, o grande volume de dados disponibilizados. Uma das muitas complexidades, variacoes e particularidades de um genoma sao os polimorfismos de base unica (single nucleotide polymorphisms - SNPs), que podem ser encontrados no genoma de individuos isoladamente ou em grupos de individuos de alguma populacao, sendo originados a partir de insercoes, remocoes ou substituicoes de bases. Alteracoes de um unico nucleotideo, como no caso de SNPs, podem modificar a producao de uma determinada proteina. O conjunto de tais alteracoes tende a provocar variacoes nas caracteristicas dos individuos da especie, que podem gerar alteracoes funcionais ou fenotipicas, que, por sua vez, implicam, geralmente, em consequencias evolutivas nos individuos em que os SNPs se manifestam. Entre os varios desafios em bioinformatica, encontram-se a descoberta e filtragem de SNPs em DNA genomico, etapas de relevância no pos-processamento da montagem de um genoma. Este trabalho propoe e desenvolve um metodo computacional capaz de filtrar SNPs em DNA genomico completo, utilizando genomas remontados a partir de sequencias oriundas de plataformas de nova geracao. O modelo computacional desenvolvido baseia-se em tecnicas de aprendizado de maquina e inteligencia computacional, com o objetivo de obter um filtro eficiente, capaz de classificar SNPs no genoma de um individuo, independente da plataforma de sequenciamento utilizada.
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://repositorio.ufjf.br/jspui/bitstream/ufjf/3496/1/brunozonovellidasilva.pdf
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article

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