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Capri: uma base de dados para análise comparativa de paradigmas paraprospecção de contatos em interfaces proteína-proteína
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Martins, Pedro Magalhaes |
| Copyright Year | 2015 |
| Abstract | Estudos que envolvem estrutura de proteinas lidam na maioria das vezes com uma grande quantidade de informacao. Para compreender melhor o processo de interacoes proteina-proteina e necessario estudar os fenomenos que ocorrem em suas interfaces moleculares. Interacoes podem ser observadas do ponto de vista de residuos, porem sabe-se que elas ocorrem na realidade em nivel atomico. Varios paradigmas propoem formas distintas para definir interacoes atomicas e sabe-se que e necessario comparar estes paradigmas para melhorar nossa compreensao sobre interacoes moleculares, permitindo abranger nosso conhecimento sobre os varios mecanismos e funcoes celulares. Com isso, propomos aqui o banco de dados CAPRI, para analise comparativa entre tres paradigmas distintos que sao usados paradefinir contatos em interface proteina-proteina. O banco de dados CAPRI possui informacoes de cerca de 45 mil complexos proteicos, contendo dados quanto as interacoes realizadas entre pares de atomos, residuos e cadeias. Ao todo, quatro tipos de interacoes sao investigadas,sendo elas: pontes de hidrogenio, interacoes hidrofobicas, pontes salinas e empilhamento aromatico. Os resultados obtidos, juntamente com a obtencao da base de dados criada podem ser acessados atraves do endereco: http://homepages.dcc.ufmg.br/~pmartins/capri1/. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | http://www.bibliotecadigital.ufmg.br/dspace/bitstream/handle/1843/BUOS-APTPBH/martins_pm_2015.pdf?sequence=1 |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
