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Résistance de la canne à sucre au SCYLV : du phénotypage d'une core collection à l'identification de marqueurs génétiques
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Débibakas, Sarah Rocher, Solen Hoarau, André Daugrois, Jean-Heinrich |
| Copyright Year | 2011 |
| Abstract | La feuille jaune de la canne a sucre est une maladie virale, vectorielle identifiee a la fin des annees 90 et est presente dans la plus part des zones productrices de canne a sucre. L'agent causal, le Sugarcane yellow leaf virus (SCYLV) est un polerovirus transmis par des pucerons dont Melanaphis sacchari, seul vecteur identifie en Guadeloupe. Le virus envahit les cellules du phloeme de l'hote. L'hote du virus, la canne a sucre, est une plante saccharifere, semi perenne, polyploide et aneuploide (100 a 130 chromosomes pour 8 a 10 chromosomes de base), d'origine bispecifique. L'amelioration varietale est relativement recente et implique peu de varietes fondatrices favorisant ainsi l'existence d'un desequilibre de liaison (DL) eleve parmi les cultivars modernes. Nous avons donc exploite cette caracteristique chez la canne a sucre pour chercher a identifier des marqueurs genetiques lies a la resistance de la plante au SCYLV. Pour cela, deux cents clones modernes de canne a sucre, d'origines geographiques diverses, ont ete suivis quand a leur infection naturelle par le SCYLV dans un dispositif a 3 blocs complets sur 2 cycles de culture (canne plantee et deuxieme repousse). Pour chaque parcelle et a chaque cycle, le SCYLV a ete diagnostique sur 10 a 15 feuilles et 8 a 10 tiges par immuno-empreinte. Le niveau d'infection de chaque echantillon a ete estime sur une echelle de 0-5 en fonction du nombre de vaisseaux vasculaires colonises. Deux valeurs quantitatives de la resistance de chaque clone ont ete estimees a partir des valeurs moyennes obtenues par parcelle et par cycle pour chaque organe echantillonne et sont nommees RF et RT (Resistance mesuree sur feuille et Resistance mesuree sur Tige). RF et RT sont significativement correlees avec un r² de 0,58. Les heritabilites au sens large, au niveau du dispositif experimental, de ces caracteres phenotypiques de resistances (RF et RT) sont respectivement de 0,895 et 0,798 et indiquent un bon controle des effets environnementaux sur les caracteres mesures. Les deux cents clones de canne a sucre ont par ailleurs ete genotypes avec un ensemble de 4189 marqueurs neutres (AFLP et DART). Les etudes d'associations entre chacun de ces marqueurs et les donnees phenotypiques de resistance RF et RT nous a permis d'identifier respectivement 51 et 21 marqueurs significativement lies a ces deux caracteres. Chacun de ces 2 ensembles de marqueurs explique respectivement 70 % et 50% de la variation phenotypique de RF et RT observee dans la population. Onze marqueurs sont communs aux 2 parametres mesures et expliquent respectivement 40% et 39 % de la variation phenotypique de RF et RT. Ces differentes informations nous indiquent que le controle genetique de l'infection se fait pour partie de facon similaire dans les 2 organes echantillonnes. Ces premiers resultats permettent d'envisager le marquage moleculaire comme outil d'aide a la selection de genotypes resistants. (Texte integral) |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | http://agritrop.cirad.fr/566626/1/document_566626.pdf |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
