Contribution à l’étude de l’histoire évolutive de la vigne cultivée (Vitis vinifera L.) par l’analyse de la diversité génétique neutre et de gènes d’intérêt

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Lacombe, Thierry
Copyright Year	2012
Abstract	Vitis vinifera L. est l'une des premieres especes fruitieres a avoir ete domestiquees. Sous l'effet de la selection humaine, cette espece a suivi une evolution agro-morphologique conduisant a une importante diversite repartie en deux morphotypes principaux selon l'usage des raisins (cuve vs table). L'objectif de cette these a ete de mieux comprendre la structuration et l'origine de la diversite genetique de la vigne domestique au travers de l'etude de marqueurs moleculaires neutres (nucleaires et chloroplastiques) et de genes codant pour des caracteres d'interet agronomique (couleur des baies et architecture des grappes). Une meilleure connaissance des ressources genetiques de la vigne est en effet necessaire pour leur gestion optimisee et leur utilisation appropriee dans de nouveaux programmes d'amelioration. Une etude de parente basee sur l'analyse de 20 microsatellites nucleaires a d'abord ete menee sur 2344 cultivars de la collection INRA du Domaine de Vassal. Elle a permis de preciser l'ascendance directe de plus de 800 cultivars et de reveler les geniteurs cles. A l'aide de ces memes marqueurs, une etude de la structuration genetique du compartiment cultive a ensuite mis en evidence quatre grands groupes de diversite relies a l'usage des fruits, la geographie et l'histoire de la viticulture. Ces premiers resultats ont ete utilises pour constituer un echantillon de travail de 595 genotypes comprenant i) des cultivars (subsp. vinifera, syn. sativa) representatifs de la diversite neutre et de categories historiques prealablement definies et ii) des representants du compartiment sauvage (subsp. sylvestris). Les resultats de l'etude de la diversite de l'ADN chloroplastique sont compatibles avec l'existence d'un centre primaire de domestication oriental et de centres secondaires repartis sur le pourtour mediterraneen. Le polymorphisme de sequence (SNP et INDEL) a ensuite ete explore pour trois genes associes a des caracteres d'interet agronomique. L'analyse de la diversite des genes VvMybA1 et VvMybA3, associes a la couleur des baies, a permis de preciser l'histoire de ce trait et sa diversification sous l'effet de la selection artificielle. L'analyse du polymorphisme du gene VvTFL1A, associe a l'architecture des grappes, a montre une structuration differente principalement en relation avec l'usage des fruits. L'ensemble des resultats a permis de mettre en evidence certaines varietes ou groupes de varietes occupant une position originale dans l'histoire de la vigne cultivee depuis sa domestication.
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	http://www.supagro.fr/theses/extranet/12-0040_Lacombe.pdf
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article