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Dénombrements directs des bactéries des milieux aquatiques par microscopie en épifluorescence : comparaison entre un système d'analyse d'images automatisé (Mudicam®) et l'observation visuelle
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Got, Patrice Baleux, Bernard Troussellier, Marc |
| Copyright Year | 1993 |
| Abstract | La technique de comptage par microscopie en epitluorescence est la methode la plus performante pour denombrer la totalite des bacteries presentes dans les milieux aquatiques. Cependant cette technique est longue, fastidieuse et subjective. Afin d'automatiser et de rendre objectif le denombrement, le microscope a epifluorescence est couple a un analyseur d'images. Si les systemes d'analyse d'images sont utilises pour les mesures de taille des bacteries aquatiques, tres peu d'etudes font etat de comparaison entre les denombrements par analyse d'image et ceux realises de facon traditionnelle. Cet article presente les resultats des denombrements de souches bacteriennes de reference et de bacteries des milieux aquatiques, par la technique de microscopie en epifluorescence des cellules bacteriennes marquees au DAPI, realises simultanement par observation microscopique visuelle (visuel) et par analyse d'images automatisee (automatique).Le systeme d'analyse d'images est compose d'une camera video (Lhesa LH40036) de sensibilite de 510-4 lux, d'une carte de numerisation (512 x 512 pixels, 8 bits, cyclope v 2.32, Digital vision) d'un micro-ordinateur 80-386 et d'un logiciel de denombrement (Mudicam®. EAU). Le systeme est couple a un microscope en epilluorescence Olympus BH2.Les denombrements ont ete realises d'une part sur des suspensions de souches bacteriennes de reference (n = 30) a differents etats physiologiques et sur des echantillons d'eaux (n = 50) d'origines diverses (fleuve, eaux saumâtre, marine et residuaire). La comparaison des deux methodes est realisee par un modele de regression lineaire et une analyse de variance. Les tests statistiques associes permettent de conclure a une bonne concordance entre les deux methodes. A partir de l'ensemble des denombrements realises, 18 d'entre eux pris au hasard ont ete denombres de facon manuelle par deux operateurs et par le systeme d'analyse d'image. Il apparait que les differences de comptage les plus elevees correspondent aux denombrements effectues par chacun des deux operateurs. Ceci met en evidence que non seulement le systeme d'analyse d'image permet une quantification rapide des abondances bacteriennes, mais en outre il supprime la subjectivite de l'operateur tout en realisant des denombrements aussi precis. |
| Starting Page | 269 |
| Ending Page | 284 |
| Page Count | 16 |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| DOI | 10.7202/705176ar |
| Volume Number | 6 |
| Alternate Webpage(s) | https://www.erudit.org/fr/revues/rseau/1993-v6-n3-rseau3272/705176ar.pdf |
| Alternate Webpage(s) | https://core.ac.uk/download/pdf/59609608.pdf |
| Alternate Webpage(s) | https://www.erudit.org/en/journals/rseau/1993-v6-n3-rseau3272/705176ar.pdf |
| Alternate Webpage(s) | https://doi.org/10.7202/705176ar |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
