Loading...
Please wait, while we are loading the content...
Similar Documents
Diversité phylogénétique et fonctionnelle des Eumycètes dans les écosystèmes pélagiques
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Portas, Marlène |
| Copyright Year | 2010 |
| Abstract | Les microorganismes jouent un role preponderant dans le fonctionnement des ecosystemes aquatiques, ou ils sont a la base de la mineralisation et du recyclage de la matiere organique. Les" vrais " champignons, ou Eumycetes, font partie de ces microorganismes heterotrophes qui permettent le renouvellement de la matiere organique dans les ecosystemes. Pourtant, la diversite et l'importance quantitative et fonctionnelle des champignons restent tres largement meconnues dans les milieux pelagiques. Recemment, l'utilisation de methodes moleculaires pour etudier la diversite des picoeucaryotes (de taille < 5 μm) lacustres a mis en evidence l'importance des champignons microscopiques avec, notamment, la presence de chytridiomycetes (chytrides). Cette decouverte, en conjonction avec le role important connu des Eumycetes dans d'autres ecosystemes naturels, nous a amene a poser l'hypothese d'une diversite et d'un role fonctionnel importants des champignons dans les ecosystemes pelagiques. Ce travail vise a preciser la diversite globale, la structure genetique et l'importance quantitative des differentes divisions du regne des Eumycota dans les ecosystemes pelagiques lacustres, et a proposer des outils methodologiques pour l'etude ecologique de ces peuplements. La diversite phylogenetique et l'importance des champignons de taille comprise entre 0,6 et 150 μm ont ete analysees dans trois milieux pelagiques differents. Une etude de clonage-sequencage de l'ADNr 18S et de l'ITS a ete realisee au printemps 2007 dans les lacs Pavin (oligomesotrophe), Aydat (eutrophe) et Vassiviere (mesotrophe, humique). L'affiliation phylogenetique des sequences a permis, non seulement de confirmer la presence d'une importante diversite de chytridiomycetes parasites du phytoplancton, mais aussi de mettre en evidence la presence non negligeable d'ascomycetes et de basidiomycetes, potentiellement saprophytes. L'etude de la dynamique saisonniere de la structure des peuplements (par TRFLP) et de l'importance quantitative de differentes divisions (par PCR quantitative) de la communaute fongique ont permis de deceler des differences en fonction des saisons et de l'ecosysteme. Ces differences ont ete reliees a la dynamique des peuplements phytoplanctoniques, avec une influence des apports allochtones, principalement dans le lac eutrophe d'Aydat. De plus, les sequences moleculaires generees au cours de ces dernieres annees ont permis l'elaboration d'amorces ciblant des clades de champignons microscopiques d'interet, pour une etude ecologique de la dynamique des peuplements, par des approches PCR a temps reel et FISH (fluorescent in situ hybridization). Enfin, nous considerons que l'acquisition de donnees complementaires permettra d'integrer les champignons saprophytes et parasites dans les flux de matiere et d'energie qui transitent par les ecosystemes pelagiques et les cycles biogeochimiques associes. |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/76/99/38/PDF/2010CLF22090-_-_Jobard-fusion.pdf |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00769938/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
