Contribution au projet de génomique structurale du virus d'Epstein-Barr : l'Uracile-ADN glycosylase et les enzymes du métabolisme des acides nucléiques

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Géoui, Thibault
Copyright Year	2006
Abstract	Le virus d'Epstein-Barr (EBV) est un γ -herpesvirus humain. Il est responsable de maladies telles que la mononucleose-infectieuse et il est associe a de nombreux carcinomes et syndromes immunoproliferatifs. A la difference d'autres herpesvirus tel que herpes-simplex, il n'existe actuellement aucun medicament efficace contre EBV. Le genome d'EBV contient 86 cadres de lecture soit autant de cibles potentielles pour une approche de genomique structurale, permettant le developpement rationnel de nouvelles therapies. La premiere serie de cibles sur laquelle nous avons travaille code pour 23 proteines. De facon inattendue, le principal probleme rencontre lors de ce projet fut la faible expression ainsi que l'insolubilite d'une grande partie des cibles. Parmi les 8 proteines solubles, 5 furent cristallisees a l'issue de quoi, 4 structures furent resolues. La clef de la reussite de ce projet fut un traitement individuel de chaque cible plutot que l'utilisation de protocoles standards. La partie centrale de ce travail porte sur l'Uracile-ADN Glycosylase (UNG). C'est une enzyme de reparation de l'ADN. Il nous fut impossible d'obtenir des cristaux de la proteine seule, mais, grâce a la formation d'un complexe avec une proteine inhibitrice produite par le phage PBS-2, nous obtinmes des cristaux diffractant a 2.3 A. La structure de ce complexe nous permis l'expliquer l'organisation de la « boucle leucine », un domaine du site actif, qui comporte une insertion de 7 residus chez tous les γ-herpesvirus. Malgre cette difference, les constantes catalytiques de l'UNG d'EBV sont proches de celles des autres UNGs ce qui suggere un mecanisme similaire d'interaction avec l'ADN. Le travail sur d'autres cibles et les difficultes qui leur sont inherentes est egalement aborde (notamment l'Alkaline Exonuclease).
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00160082/document
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article