NDLI: Une théorie de la fonctionnelle de la densité moléculaire pour la solvatation dans l'eau

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Une théorie de la fonctionnelle de la densité moléculaire pour la solvatation dans l'eau

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Jeanmairet, Guillaume
Copyright Year	2014
Abstract	La theorie de la fonctionnelle de la densite classique est utilisee pour etudier la solvatation de solutes quelconques dans le solvant eau. Une forme approchee de la fonctionnelle d'exces pour l'eau est proposee. Cette fonctionnelle necessite l'utilisation de fonctions de correlation du solvant pur. Celles-ci peuvent etre calculees par simulations numeriques, dynamique moleculaire ou Monte Carlo ou obtenues experimentalement. La minimisation de cette fonctionnelle donne acces a l'energie libre de solvatation ainsi qu'a la densite d'equilibre du solvant. Differentes corrections de cette fonctionnelle approchee sont proposees. Une correction permet de renforcer l'ordre tetraedrique du solvant eau autour des solutes charges, une autre permet de reproduire le comportement hydrophobe a longue distance de solutes apolaires. Pour realiser la minimisation numerique de la fonctionnelle, la theorie a ete implementee sur une double grille tridimensionnelle pour les coordonnees angulaires et spatiales, dans un code de minimisation fonctionnelle ecrit en Fortran moderne, mdft. Ce programme a ete utilise pour etudier la solvatation en milieu aqueux de petits solutes atomiques neutres et charges et de petites molecules polaires et apolaires ainsi que de solutes plus complexes, une argile hydrophobe et une petite proteine. Dans chacun des cas la theorie de la fonctionnelle de la densite classique permet d'obtenir des resultats similaires a ceux theoriquement exacts obtenus par dynamique moleculaire, avec des temps de calculs inferieurs d'au moins trois ordres de grandeurs.
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01067993/document
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/file/index/docid/1067993/filename/these_archivage_2704256opti.pdf
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article

Sl.	Authority	Responsibilities	Communication Details
1	Ministry of Education (GoI), Department of Higher Education	Sanctioning Authority	https://www.education.gov.in/ict-initiatives
2	Indian Institute of Technology Kharagpur	Host Institute of the Project: The host institute of the project is responsible for providing infrastructure support and hosting the project	https://www.iitkgp.ac.in
3	National Digital Library of India Office, Indian Institute of Technology Kharagpur	The administrative and infrastructural headquarters of the project	Dr. B. Sutradhar bsutra@ndl.gov.in
4	Project PI / Joint PI	Principal Investigator and Joint Principal Investigators of the project	Dr. B. Sutradhar bsutra@ndl.gov.in Prof. Saswat Chakrabarti will be added soon
5	Website/Portal (Helpdesk)	Queries regarding NDLI and its services	support@ndl.gov.in
6	Contents and Copyright Issues	Queries related to content curation and copyright issues	content@ndl.gov.in
7	National Digital Library of India Club (NDLI Club)	Queries related to NDLI Club formation, support, user awareness program, seminar/symposium, collaboration, social media, promotion, and outreach	clubsupport@ndl.gov.in
8	Digital Preservation Centre (DPC)	Assistance with digitizing and archiving copyright-free printed books	dpc@ndl.gov.in
9	IDR Setup or Support	Queries related to establishment and support of Institutional Digital Repository (IDR) and IDR workshops	idr@ndl.gov.in