Du gène au phénotype : contrôle génétique et modélisation du métabolisme des sucres chez la pêche

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Desnoues, Elsa
Copyright Year	2015
Abstract	La qualite du fruit est un caractere multicritere avec des relations antagonistes frequentes. La perception de la qualite du fruit depend fortement de l'equilibre entre les teneurs en sucres et acides. Parmi les 3 sucres dits majeurs dans les fruits que sont le saccharose, le glucose et le fructose, le fructose presente un pouvoir sucrant plus important et sa concentration est le facteur qui affecte le plus le gout sucre du fruit.L'objectif de cette these est d'analyser le metabolisme des sucres chez la peche d'un point de vue metabolique, enzymatique et genetique et d'integrer dans un modele mathematique l'ensemble des informations obtenues. Ce travail porte plus particulierement sur la mise en evidence de l'effet d'une perturbation de la teneur en fructose sur l'ensemble du metabolisme des sucres ainsi que sur la comprehension des mecanismes a l'origine de ce phenotype appele 'peu de fructose'. Une caracterisation biochimique quasi-exhaustive du metabolisme des sucres a ete realisee au cours du developpement du fruit.Pour cela 6 metabolites et 12 capacites enzymatiques ont ete mesures chez 106 genotypes d'une population issue d'un croisement interspecifique. Cette etude a revele une grande stabilite des capacites enzymatiques malgre l'importante variation des metabolites. Sur la base des donnees de 10 des genotypes, un modele metabolique dynamique permettant de simuler l'accumulation des sucres au cours du developpement du fruit a ete developpe et valide. Ce modele permet de simuler des phenotypes contrastes et aide ainsi a l'exploration des mecanismes sous-jacents au phenotype 'peu de fructose'. La caracterisation biochimique de la population a egalement fait l'objet d'une recherche de QTL. Cette etude a mis en exergue l'inconstance de l'effet de certains loci au cours du developpement du fruit ainsi que des co-localisations de QTL de metabolites et capacites enzymatiques et de genes candidats. Cette recherche a egalement confirme la region genomique responsable du phenotype 'peu de fructose' au sein de laquelle un gene candidat fonctionnel a ete mis en evidence. Il s'agit d'un gene homologue au transporteur vacuolaire exportateur de fructose (SWEET17) decouvert recemment chez Arabidopsis. Une analyse de ce gene a ete engagee afin de valider sa fonction et son implication dans le phenotype 'peu de fructose'. Grâce a l'integration des informations obtenues sur le controle genetique du metabolisme des sucres dans le modele metabolique,une perspective de cette these sera de simuler les concentrations en sucres de genotypes virtuels ayant differentes combinaisons d'alleles. On pourra alors optimiser les combinaisons d'alleles pour augmenter les concentrations en sucres dans la peche, ce qui donnera sans doute de nouvelles pistes a l'innovation varietale.
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01366023/document
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article