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Impact de l’essence forestière sur les processus de dégradation et d’assimilation des polysaccharides végétaux par la communauté fongique des sols forestiers
| Content Provider | Semantic Scholar |
|---|---|
| Author | Barbi, Florian |
| Copyright Year | 2015 |
| Abstract | En milieu forestier, la decomposition de la matiere organique d’origine vegetale et son assimilation par les microorganismes sont des processus essentiels au bon fonctionnement des sols et du cycle du carbone. Les mecanismes impliques dans ces phenomenes de degradation sont fortement controles par les champignons saprotrophes qui secretent de nombreuses enzymes hydrolytiques afin d’acceder a leur principale source de nutriments qui se trouve sous la forme de polysaccharides (cellulose et hemicelluloses). L’hydrolyse enzymatique de ces polymeres vegetaux engendre une grande diversite de composes de faible poids moleculaire (mono- et oligosaccharides). Ces molecules penetrent dans la cellule fongique via des systemes de transporteurs membranaires dont la presence/absence et la specificite de substrat contribuent a la versatilite metabolique de ces microorganismes du sol. La nature de l’essence forestiere affecte fortement la diversite et la composition des communautes fongiques. Dans ce contexte, nous avons emis l’hypothese que les communautes fongiques selectionnees par les differentes essences forestieres different entre elles par la diversite des mecanismes qu’elles mettent en place lors du processus de decomposition de la matiere organique d'origine vegetale et lors du transport des produits de degradation ; et que de ce fait chaque communaute fongique est specifiquement adaptee a la nature de la litiere produite par l’espece vegetale consideree. Par des approches de sequencage haut-debit d’amplicons generes a partir d’ADNc environnementaux, nous avons analyse la diversite des transcrits codant des proteines fongiques impliquees a la fois dans la degradation des polysaccharides vegetaux et dans le transport des sucres issus de cette hydrolyse enzymatique au sein de sols localises sous des forets de hetres et d’epiceas. L’analyse des donnees obtenues a mis en evidence des transcrits jusqu’alors inconnus et specifiquement retrouves pour plus 80% d’entre eux sous l’un des deux couverts vegetaux conduisant ainsi a un effet significatif de l’essence forestiere sur la composition des genes exprimes par les communautes fongiques. Des transporteurs potentiellement specifiques du mannose ont ete detectes, pour la premiere fois, sous la foret d’epiceas par une approche de crible fonctionnel dans la levure de banques d’ADNc environnementaux. Or, cette essence forestiere est connue pour posseder d’importantes quantites de mannose au niveau de ses hemicelluloses. Les resultats obtenus au cours de cette these soulignent l’importance d’etudier la diversite fonctionnelle des communautes fongiques pour comprendre l’impact du couvert vegetal sur leur composition et le fonctionnement des ecosystemes forestiers |
| File Format | PDF HTM / HTML |
| Alternate Webpage(s) | https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01666043/document |
| Language | English |
| Access Restriction | Open |
| Content Type | Text |
| Resource Type | Article |
