O32 La variabilité du nombre de copies de gènes est associée à l’hypertension dans le diabète de type 2

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Tremblay, Johanne Raelson, John Verner Harvey, Francois Ivanga, Mahiné Chalmers, John Woodward, Mark Harrap, Stephen B. Marre, Michel Hamet, Pavel
Copyright Year	2014
Abstract	Introduction Le diabete et l’hypertension ont une composante genetique dont une proportion de l’heritabilite manquante pourrait etre due a des variations du nombre de copies (CNV) de genes. Afin d’identifier ces variations, nous avons procede a des criblages genomiques complets (GWAS) de CNV avec plusieurs phenotypes et complications du diabete de de type 2 (DT2). Materiels et methodes Les GWAS ont ete faits chez 3 449 patients d’origine caucasienne ayant participe a l’etude clinique ADVANCE. 31 phenotypes micro- et macrovasculaires quantitatifs et 23 phenotypes qualitatifs ont ete determines. Les genotypes du nombre de copies ont ete determines a l’aide de puces d’ADN d’Affymetrix 6.0 et 5.0 par les algorithmes PennCNV et ParseCNV. Le niveau de significativite a ete determine empiriquement en repetant les analyses GWAS avec des donnees permutees. Resultats 19 deletions et 9 duplications sont significativement associees a 12 phenotypes qualitatifs alors que 7 deletions et 4 duplications sont significativement associees a 9 phenotypes quantitatifs. Parmi ceux-ci, on retrouve plusieurs CNV associes significativement a l’hypertension. Une deletion frequente au locus 3p14.1 dans le gene FAM19A4 est associee a l’hypertension chez les femmes et une deletion protective au chr2 : 49386546-49394694 a 151,4 kb en amont du gene FSHR est aussi associe a l’hypertension chez les femmes. Or, les souris femelles KO pour ce gene sont hypertendues. Des CNV qui incluent des deletions et des duplications dans un cluster de genes KRTAP9 sur le chr17q21.2 ainsi qu’une duplication sur le chr11p15.4 dans le gene TRIM22 sont significativement associes a l’hypertension chez les deux sexes. Conclusion Nos resultats ont permis d’identifier des CNV associes a l’hypertension chez les patients diabetiques. Ces CNV seront valides dans d’autres populations et leur importance sera evaluee sur la fonction de ces genes ainsi que sur leur valeur predictive des issus cliniques.
File Format	PDF HTM / HTML
DOI	10.1016/S1262-3636(14)72206-2
Volume Number	40
Alternate Webpage(s)	https://www.em-consulte.com/showarticlefile/882195/main.pdf
Alternate Webpage(s)	https://doi.org/10.1016/S1262-3636%2814%2972206-2
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article