NDLI: Analyse des groupes de gènes co-exprimés : un outil automatique pour l'interpretation des expériences de biopuces

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Analyse des groupes de gènes co-exprimés : un outil automatique pour l'interpretation des expériences de biopuces

Content Provider	Semantic Scholar
Author	Martinez, Ricardo Pasquier, Nicolas Pasquier, Catherine Collard, Martine
Copyright Year	2006
Abstract	La technologie des biopuces permet de mesurer les niveaux d'expression de milliers de genes dans differentes conditions biologiques generant ainsi des masses de donnees a analyser. De nos jours, l'interpretation de ces volumineux jeux de donnes a la lumiere des differentes sources d'informations est l'un des principaux defis dans la bio-informatique. Nous avons developpe une nouvelle methode appelee AGGC (Analyse des Groupes de Genes Co-exprimes) qui permet de constituer de maniere automatique des groupes de genes a la fois fonctionnellement riches, i.e. qui partagent les memes annotations fonctionnelles, et co-exprimes. AGGC integre l'information issue des biopuces, i.e. les profils d'expression des genes, avec les annotations fonctionnelles des genes obtenues a partir des sources d'informations genomiques comme Gene Ontology. Les experimentations menees avec cette methode ont permis de mettre en evidence les principaux groupes de genes fonctionnellement riches et co-exprimes dans des experiences de biopuces. Programme et informations annexes : http://keia.i3s.unice.fr/?Implementations:CGGA.
File Format	PDF HTM / HTML
Alternate Webpage(s)	https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00363018/document
Alternate Webpage(s)	https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00361718/file/Analyse_des_groupes_de_genes_co-exprimes_un_outil_automatique_pour_l_interpretation_des_experiences_de_biopuces_Martinez_et_al._RNTI_2008.PDF
Alternate Webpage(s)	http://nyx.unice.fr/publis/martinez-pasquier-etal:2006.pdf
Alternate Webpage(s)	https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00361718/document
Language	English
Access Restriction	Open
Content Type	Text
Resource Type	Article

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